自动化检测系统在微生物鉴定中能够显著提升效率，主要通过以下几个方面来实现：

1.高效筛选：自动化系统可以快速处理大量样本，并利用先进的算法对结果进行初步筛查。这大大减少了人工操作的时间和错误率。

2.快速识别：现代自动化设备配备了高度敏感的检测器和复杂的数据库，能够迅速准确地鉴定微生物种类。例如，基于质谱技术或分子生物学方法（如PCR）的自动分析平台可以在几分钟内完成对目标菌株的确认。

3.标准化流程：通过标准化的操作程序和条件控制，自动化系统确保了每次实验的一致性和可重复性，避免了人为因素导致的结果偏差。

4.数据管理与共享：自动化检测系统通常连接有强大的信息管理系统，可以自动记录、分析并存储大量数据。这不仅方便了结果的解读和报告生成，还促进了科研人员之间的交流与合作。

5.减轻劳动强度：自动化设备能够连续工作而不疲劳，降低了实验室工作人员的工作压力，并提高了整个检验过程的安全性。

综上所述，通过提高工作效率、保证检测精度以及优化资源配置等手段，自动化检测系统有效加速了微生物鉴定的速度。