慢性淋巴细胞性甲状腺炎，也称为桥本氏病，是一种自身免疫性疾病。其主要病因是机体免疫系统对甲状腺组织产生异常反应，导致甲状腺细胞被自身的免疫细胞攻击和破坏。

在中医理论中，慢性淋巴细胞性甲状腺炎多与肝气郁结、脾肾阳虚等因素有关。认为情志不畅可以导致肝气郁结，进而影响到气血运行；而长期的劳倦伤及脾胃，使脾失健运，不能正常化生气血，造成正气不足，易于感受外邪或内生痰湿等病理产物，最终累及甲状腺。

西医方面，则认为该病的发生与遗传因素、环境因素以及自身免疫功能紊乱有关。具体来说：
1. 遗传倾向：家族中有慢性淋巴细胞性甲状腺炎患者的人群发病风险较高。
2. 环境因素：包括感染（如病毒）、饮食中碘摄入过量或不足等都可能诱发疾病。
3. 免疫系统异常：T细胞和B细胞的功能失调，产生针对甲状腺自身抗原的抗体，如抗甲状腺球蛋白抗体、抗微粒体抗体等。

综上所述，慢性淋巴细胞性甲状腺炎的确切病因尚不完全清楚，但与遗传背景、环境因素及免疫调节失常密切相关。在临床治疗时，中西医结合的方法可以更好地发挥各自优势，提高疗效。