成都中医药大学医学信息工程学院以信息化促进我国医疗卫生事业发展是国家的重大发展战略，医学信息工程专业是我国医疗卫生事业发展的朝阳学科。2012年学校整合校内优势资源，组建了全新的医学信息工程学院，2013年开始招收4年制医学信息工程专业本科学生。

学院拥有从事教学、科研、网络技术服务的专业团队43人，其中教师队伍高级职称比率达到30%，拥有国家中医药管理局重点培育学科——中医药信息学，以及数字医药工程、医学信息和计算机基础3个教研室。

学院与学校数字医药研究所医|学教育网搜集整理、现代教育信息技术中心三位一体，集成了科研、教学和网络应用管理的多方优势。其中，数字医药研究所在中医药信息化领域的研究水平居全国领先。代表项目有中药行业的第一个物联网项目——“中药溯源系统研究”，该项目2011年得到国家商务部、药监局、中医药管理局的联合试点批文，2012年国家投入资金已超过1个亿，是惠及民生的“放心中药”工程； 国家重大专项“慢性传染病证侯生物信息平台研究”得到了国家科技部十一五、十二五持续支持；承担的全国第四次中药资源普查“动态预警及省级数字化平台”研究也取得重要进展；与世界顶级网络设备企业思科公司合作的“地震灾区基层卫生信息系统研究”创造了数字中医诊疗软件开发多个全国第一……研究所目前在国内数字化中医诊疗系统、中药与互联网、中医生物信息等领域拥有数十个软件成果和专利技术。现代教育信息技术中心是国家中药现代化（四川）基地的信息化支撑单位，在负责全校的“数字化校园”建设工作的同时，承担了大量四川省中医药行业信息化任务。学院拥有全国中医院校一流的网络设备、信息化系统和测试实验室、软硬件开发环境。