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罗马Ⅲ型诊断标准中FD分为2个亚型，即餐后不适综合征和上腹疼痛综合征。依据罗马III诊断标准，功能性消化不良必须符合以下一点或一点以上：餐后饱胀不适；早饱；上腹痛；上腹灼烧感。

FD为一排除性诊断疾病，在临床实际工作中，既要求不漏诊器质性疾病，又不应无选择性地对每例患者进行全面的实验室及特殊检查。

1.全面病史采集和体格检查的基础上，应先判断患者有无下列器质性疾病的“报警症状和体征”：45岁以上，近期出现消化不良症状，有消瘦、贫血、呕血、黑粪、吞咽困难、腹部肿块、黄疸等，消化不良症状进行性加重。

2.对有“报警症状和体征”者，必须进行彻底检查直至找到病因。

3.对年龄在45岁以下且无“报警症状和体征”者，可选择基本的检查如血常规、尿常规、粪隐血试验、血沉、肝功能试验、胃镜、腹部B超（肝、胆、胰），或先予经验性治疗2～4周观察疗效，对诊断可疑或治疗无效者有针对性地选择进一步检查。