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1、形态与染色：肠杆菌科的细菌均为革兰染色阴性杆菌，菌体大小为（1.0-6.0）μm×（0.3-1.0）μm.多数有周鞭毛，能运动，少数菌属如志贺菌属和克雷伯菌属无鞭毛，无运动能力。均不形成芽孢，少数菌属细菌可形成荚膜。

2、培养和生化特征：需氧或兼性厌氧，营养要求不高，在普通琼脂培养基和麦康凯培养上均能生长并形成中等大小的菌落，表面光滑，液体培养基中呈混浊生长。发酵葡萄糖产酸、产气，触酶试验阳性，除少数菌外，氧化酶阴性。硝酸盐还原反应阳性（但欧文菌属和耶尔森菌属等菌株例外）。在血琼脂平板上，有些菌可产生溶血圈。

3、抗原构造肠杆菌科细菌的抗原构造复杂。包括菌体抗原（O抗原），鞭毛抗原（H抗原）和表面抗原（Vi抗原、K抗原）3种。

O抗原和H抗原是肠杆菌科血清学分群和分型的依据。

表面抗原为包绕在O抗原外的不耐热的多糖抗原，可阻断O抗原与相应抗体之间的反应，加热处理能破坏其阻断作用。

4、变异性：包括菌落S-R变异和鞭毛H-O变异。肠道杆菌易出现变异菌株。表现为耐药性或生化反应性质的改变。肠道杆菌易变异在细菌学诊断，治疗方面具有重要意义。

5、抵抗力：不强。加热60℃，30分钟即被杀死。不耐干燥，对一般化学消毒剂敏感。对低温有耐受力，不耐胆盐。

6、肠杆菌科的初步分类可根据苯丙氨酸脱氨酶试验和葡萄糖酸盐试验将肠杆菌科初步分为三大类。

菌属名 苯丙氨酸 葡萄糖酸盐

变形杆菌属 + －

普罗威登菌属 + －

摩根菌属 + －

克雷伯菌属 － +

肠杆菌属 － +

沙雷菌属 － +

哈夫尼亚菌属 － +

埃希菌属 － －

志贺菌属 － －

沙门菌属 － －

枸橼酸杆菌属 － －

爱德华菌属 － －

耶尔森菌属 － －