自体瓣膜感染性心内膜炎（Infective Endocarditis, IE）的常见病原体主要包括细菌和少数情况下真菌。其中，细菌是最常见的致病因素，具体包括：

1.草绿色链球菌群：这是最常见的致病菌之一，约占所有病例的30%-40%。

2.金黄色葡萄球菌：近年来其发病率有所上升，特别是在注射药物使用者中更为常见。

3.肠球菌属：如粪肠球菌和屎肠球菌等。

4.表皮葡萄球菌及其他凝固酶阴性葡萄球菌。

5.其他链球菌：例如口腔内的α溶血性链球菌、肺炎链球菌等。

6.革兰氏阴性杆菌：如大肠埃希菌、克雷伯菌属等，通常发生在有严重基础疾病或免疫功能低下的患者中。

真菌感染相对少见，但也有报道，主要包括念珠菌和曲霉菌等。此外，在某些特殊情况下，立克次体、衣原体以及病毒也可能成为致病因素。临床上需要根据患者的临床表现、流行病学史及实验室检查结果来确定具体的病原体，并据此选择合适的治疗方案。

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