颅面部骨骼发育异常的原因有很多，主要可以归纳为遗传因素、环境因素、代谢性疾病以及机械性因素等。具体来说：

1.遗传因素：很多颅面骨发育不良的情况与遗传有关，比如先天性畸形如唇腭裂、颅缝早闭症（一种或多种颅缝过早闭合导致的头形异常）、Apert综合症等。

2.环境因素：母亲在怀孕期间受到某些化学物质或者放射线的影响，也可能影响胎儿的正常发育。此外，营养不良也是重要的环境因素之一。

3.代谢性疾病：如佝偻病、甲状腺功能亢进或减退等内分泌疾病可引起骨骼生长异常；钙磷代谢障碍也会导致骨质疏松等问题。

4.机械性因素：长期的不正确姿势或者外力作用（例如儿童睡眠时头部受压）可能导致局部骨骼变形。

5.其他原因：包括感染、肿瘤等因素也有可能影响颅面部骨骼的正常发育。

对于这些发育异常，早期诊断和干预是非常重要的，可以采取手术矫正、佩戴矫形器等方法进行治疗。同时，多学科协作（如口腔科、整形外科、儿科等）在诊治过程中起到关键作用。