常用的抗疟药物主要包括氯喹、青蒿素类药物（如青蒿琥酯、双氢青蒿素）、奎宁、甲氟喹和阿托伐醌等。这些药物根据其作用机制和临床应用特点，适用于不同阶段的疟疾治疗：
1. 氯喹：这是一种广谱抗疟药，主要用于预防和治疗间日疟以及对氯喹敏感的恶性疟原虫感染。它能够快速杀灭红细胞内的疟原虫，对于控制症状非常有效。
2. 青蒿素类药物：这类药物具有较强的速效性和低毒性特点，适用于急性发作期尤其是重症疟疾患者。其中青蒿琥酯和双氢青蒿素常用于临床治疗恶性疟疾，并且可以与其他抗疟药联合使用以提高疗效。
3. 奎宁：在氯喹耐药性较高的地区，奎宁可作为替代药物来治疗恶性疟原虫感染。它主要用于控制症状，但单独使用时复发率较高，通常需要与伯氨喹等其他药物合用。
4. 甲氟喹：该药对多种类型的疟原虫都有良好的效果，特别是用于治疗对氯喹产生耐药性的恶性疟疾病例。它可以作为单药或与其他抗疟药联合应用以增强疗效。
5. 阿托伐醌：这是一种相对新型的口服抗疟药物，主要用于预防和治疗由恶性疟原虫引起的疟疾病例。它具有较好的安全性和耐受性，适用于成人及儿童患者。

在使用上述任何一种抗疟药物时，都应根据患者的具体情况（如感染类型、病情严重程度等）以及当地疟疾的流行状况和药物敏感性测试结果来选择合适的治疗方案，并严格遵循医生指导。