根据《黄帝内经》的理论，五脏和六腑之间的功能关系主要体现在相辅相成、相互制约两个方面。五脏指的是心、肝、脾、肺、肾；六腑则包括胆、胃、大肠、小肠、膀胱、三焦。

首先，在生理功能上，《内经》认为“藏象”理论是理解人体内部器官之间关系的基础。“藏”指的就是五脏，“象”则是指这些器官所表现出来的外在特征和作用。《素问·六节藏象论》中提到：“心者，君主之官也，神明出焉；肺者，相傅之官，治节出焉；肝者，将军之官，谋虑出焉；胆者，中正之官，决断出焉；脾胃者，仓廪之官，五味出焉；大肠小肠者，传道之官，变化出焉；肾者，作强之官，伎巧出焉”。这段话不仅描述了各个器官的基本功能，还强调了它们之间密切的联系和协作。

其次，在病理上，《内经》指出五脏与六腑之间的疾病可以相互影响。例如《素问·玉机真藏论》中说：“胃病则心痛”，说明胃部出现问题可能会影响到心脏的功能；又如“肝气乘脾，则飧泄”，表明肝脏功能异常时，会干扰到脾胃的消化吸收过程。

此外，《内经》还强调了五脏与六腑之间的阴阳平衡关系。在中医理论中，五脏属阴，主藏精气而不泻；六腑属阳，主传化物而不藏。两者之间存在着动态平衡的关系，即“阴平阳秘”，只有当这种平衡被打破时，人体才会出现各种病症。

综上所述，《内经》对于五脏与六腑功能关系的描述，不仅涵盖了它们各自独立的功能特点，更重要的是揭示了二者间相辅相成、相互制约的整体观念。这为后世中医学的发展奠定了坚实的基础，并对临床实践具有重要指导意义。