针灸治疗咽喉肿痛主要基于中医理论中的经络和穴位概念。在中医看来，人体内外环境是一个有机整体，通过经络系统相互联结，而穴位则是经络上特定的点，刺激这些点可以调节体内的气血运行，达到治疗疾病的目的。

对于咽喉肿痛这一症状，针灸疗法主要从以下几个方面发挥作用：
1. 调节局部血液循环：通过对相关穴位进行适当的针刺或艾灸等操作，能够促进颈部、喉部区域的血液循环，加速炎症物质的吸收和排出，从而缓解因炎症引起的红肿热痛等症状。
2. 激发机体免疫功能：针灸可以通过刺激神经系统来增强人体免疫力，提高抗病能力。例如，针刺合谷穴（位于手背第一二掌骨之间）可以激发上呼吸道黏膜免疫反应，有助于抵抗病毒细菌感染。
3. 调和阴阳平衡：根据中医理论，疾病的发生往往与体内阴阳失衡有关。针对咽喉肿痛的患者，医生会依据其具体病情选择合适的穴位进行针灸治疗，以达到调和阴阳、恢复健康的目的。如取天突穴（位于颈前正中线上，胸骨上窝凹陷处）可以清热解毒、利咽开音。
4. 缓解疼痛：通过刺激特定的止痛穴位，如少商穴（拇指桡侧指甲角旁约0.1寸），能够有效缓解咽喉部位的疼痛感。此外，针灸还具有镇静作用，可减轻患者的紧张情绪，有利于病情恢复。

综上所述，针灸治疗咽喉肿痛是通过改善局部血液循环、激发机体免疫功能、调和阴阳平衡以及缓解疼痛等多种机制共同起效的。但需要注意的是，在实际临床应用中，应由具备专业资质的中医师根据患者的具体情况制定个性化的治疗方案。