西医对疾病发生机制的理解基于现代生物学、分子生物学和遗传学等多学科的知识体系。大致可以从以下几个方面进行阐述：
1. 遗传因素：许多疾病与基因变异有关，如单基因遗传病（例如囊性纤维化）、多因子遗传病（如2型糖尿病）以及染色体异常导致的疾病（如唐氏综合症）。这些遗传变化可能影响细胞功能、蛋白质结构或代谢途径。
2. 环境因素：环境暴露也是引起疾病的常见原因，包括物理性（如放射线）、化学性（如有毒物质）和生物性（如病毒、细菌感染）等。例如，长期吸入石棉纤维可导致肺部疾病；某些病毒可以引发癌症或免疫系统紊乱。
3. 免疫反应：当机体的免疫功能失调时，可能出现自身免疫性疾病（如类风湿关节炎）、过敏反应（如哮喘）或者免疫缺陷病（如艾滋病）。此外，在一些情况下，过度活跃的炎症反应也可能损害正常组织，导致慢性疾病的发生。
4. 生活方式与行为因素：不健康的饮食习惯、缺乏运动、吸烟饮酒等不良生活方式是心血管疾病、肥胖症等多种慢性非传染性疾病的重要诱因。同时，压力过大或睡眠不足也会对身体健康产生负面影响。
5. 细胞损伤与修复机制失衡：细胞在受到各种内外源性刺激后可能会发生损伤，若无法有效修复，则可能导致细胞凋亡或坏死，进而影响器官功能。例如，在缺血再灌注过程中产生的自由基可引起心肌细胞死亡；肿瘤的发生往往伴随着DNA修复能力的下降。
6. 代谢紊乱：体内物质交换和能量转换过程中的异常也可能是某些疾病的基础，如糖尿病是因为胰岛素分泌不足或作用障碍而引起的糖脂代谢失衡。

总之，西医认为疾病的产生是多因素共同作用的结果，并且通过研究这些机制来寻找预防、诊断及治疗的方法。