对于乡村全科执业助理医师来说，遇到患者主诉咽痛并伴有发热的情况时，首先需要进行详细的病史询问和体格检查。了解患者的年龄、性别、职业、生活习性等基本信息；重点询问发病时间、症状发展过程、有无接触史（如近期是否与感冒或传染病患者密切接触）、既往疾病史、过敏史以及目前使用的药物情况。

在体格检查方面，要特别注意观察患者的一般状态，包括精神面貌、面色、呼吸状况等，并仔细检查咽喉部，看是否有红肿、溃疡、分泌物等情况。同时也要关注颈部淋巴结是否肿大，以及其他可能的伴随症状如咳嗽、流涕、声音嘶哑等。

根据初步判断，可以将咽痛伴发热大致分为以下几种情况：
1. 急性上呼吸道感染：多由病毒引起，表现为急性起病，除咽痛和发热外，常伴有鼻塞、流涕等症状。治疗主要是对症支持疗法，比如充分休息、多饮水、使用解热镇痛药物缓解症状等。
2. 细菌性咽炎或扁桃体炎：患者可能有高烧不退、吞咽困难等表现，且局部检查可见明显红肿甚至脓点。此时需要考虑使用抗生素治疗，并密切监测病情变化。
3. 其他原因引起的咽痛伴发热：如风湿热、白血病早期等较为罕见的情况，需结合临床特点及辅助检查进一步明确诊断。

总之，在处理这类患者时应遵循个体化原则，综合评估后制定合理的诊疗计划。同时也要提醒患者注意个人卫生习惯，避免交叉感染，并按医嘱规范用药。如果症状持续不见好转或出现严重并发症，则应及时转诊上级医院进行更深入的诊治。