当医疗机构在检测中发现患者为HIV阳性时，应当采取一系列规范化的措施来确保患者的健康权益得到充分保障，并且能够有效地防止疾病的进一步传播。具体步骤如下：
1. 确认诊断：初次筛查呈阳性的结果需要通过更准确的确认试验（如Western Blot或免疫印迹法）进行验证，以排除假阳性的情况。
2. 保密原则：对于确诊为HIV阳性的患者信息必须严格保密，不得随意泄露给无关人员。只有在法律允许的情况下，并且为了患者的治疗目的，方可向相关医疗人员透露必要的健康状况信息。
3. 心理支持与咨询：及时提供专业的心理辅导和咨询服务，帮助患者正视病情、调整情绪状态，增强其面对疾病的信心和社会适应能力。
4. 治疗指导：根据国家艾滋病防治工作规划及相关指南，为HIV感染者制定个性化的抗病毒治疗方案，并定期随访监测疗效及副作用情况。同时告知患者按时服药的重要性以及可能存在的风险和并发症。
5. 健康教育：向患者普及有关预防传播的知识，包括正确使用安全套、避免高危行为等措施；强调个人卫生习惯的养成对于防止疾病扩散的意义。
6. 法律权益保障：确保HIV阳性患者的合法权益不受侵犯，如就业机会平等、隐私权保护等方面。必要时可协助其寻求法律援助。
7. 社会支持网络建设：鼓励患者参与互助小组或社区组织，通过与其他病友交流分享经验来获得情感上的慰藉和支持力量。
8. 通知公共卫生部门：按照国家规定向当地疾病预防控制中心报告HIV阳性病例，并配合完成流行病学调查工作。这有助于掌握区域内的疫情动态，为制定更有效的防控策略提供依据。

以上措施旨在构建一个全面、科学的管理体系，既关注个体患者的需求，也着眼于整个社会层面的公共安全与健康福祉。