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牙髓是疏松结缔组织，它包含有细胞、纤维、神经、血管、淋巴管和其他细胞外基质。成纤维细胞又称为牙髓细胞，是牙髓中的主要细胞。成牙本质细胞位于牙髓周围与前期牙本质相连处，位于牙本质小管内。巨噬细胞和未分化的间充质细胞，通常在炎症时发挥作用。能形成第三期牙本质的细胞被称为未分化的间充质细胞、多潜能间质细胞，它们是牙髓干细胞，有多向分化的潜能。树突状细胞属抗原呈递细胞，T淋巴细胞包括有CD4和CD8阳性细胞，是主要的免疫反应细胞。
牙髓的细胞间质包括纤维、基质、血管、淋巴管和神经等。进入牙髓的神经大多数是有髓神经，传导痛觉，牙髓内血管丰富，可通过根尖孔交通和副根管，成为牙髓炎症感染通道。
牙髓在牙发育完成后，随着年龄的增长不断形成继发性牙本质，出现退行性改变。牙髓内的神经常反应为痛觉，而不能区分冷、热、压力及化学变化，因为牙髓缺乏对这些刺激的感受器，同时还缺乏定位能力，故牙髓炎患者不能准确指出痛牙的部位。牙髓有修复再生的能力，但能力有限。
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